Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms