Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms