Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms