Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF12Q8WXF0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms