Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms