Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms