Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM41Q8WV44 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM41Q8WV44 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms