Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDD1Q8TEB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms