Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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