Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms