Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms