Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf106Q8NAJ2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms