Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms