Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS37DQ86XT2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37DQ86XT2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms