Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms