Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX29Q7Z478 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms