Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms