Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SETXQ7Z333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms