Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CATSPER4Q7RTX7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms