Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms