Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms