Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms