Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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