Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms