Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSMD4Q5XG99 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSMD4Q5XG99 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSMD4Q5XG99 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSMD4Q5XG99 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms