Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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