Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms