Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms