Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms