Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDLIM3Q53GG5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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