Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms