Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAL1Q4LDG9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAL1Q4LDG9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms