Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms