Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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