Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms