Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms