Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPHKAPQ2M3C7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms