Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms