Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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