Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFE2Q16621 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms