Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC37Q16543 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms