Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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