Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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