Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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