Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIBQ15653 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms