Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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