Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CLCA4Q14CN2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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