Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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