Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms