Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms